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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原动物群特男人、寡核苷酸突显成本费用高出平常许多的或操作步骤工艺流程很复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯副教授开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低的成本、跨动物群、全软件平台兼容的全新解决方案。

论文期刊简价

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内内地实验院隐性基因性与发育期怪物学学习所和国内内地隐性基因性學會主办者的全球学术界交流刊物,倾力于媒体报道一生实验和医疗隐性基因性学邻域的原创度性学习工作成果。JGG 2021年度不良影响系数7.1,Scopus学术界交流刊物判断质量指标CiteScore 9.9,跻身JCR 2021年度GENETICS & HEREDITY邻域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY邻域Q1区,跻身国内内地实验院刊物区别怪物学类1区(Top刊物),隐性基因性学和什么是生化与原子怪物学小类双1区。

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什么东西是HEATag

婉转的“二三合一”装修设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的溶合淀粉酶

「导航定位器」模块图片 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「链接器」信息模块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引长条码确定共价链接。

“1+1>2”的功能:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行范例标注与朔源。

Fig1: HEATag多个符号方法示图图

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实际的定期检查

HEATag知乎问答有可以打?

能在不一样的先决条件下,体现乳期生物神经肿瘤细胞系单神经肿瘤细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研究探讨团体为 HEATag 配置了多轮 “压测式”,从神经神经细胞系到神经神经细胞,从室温到超高温,从新鲜模本到固定不变模本,全位置检验它的稳确定高性和是真的吗性。

第1 轮测验共性喂乳生物人体体组织细胞系:钻研员使用了存在人、鼠、仓鼠六个植物动物群的两种人体体组织细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在温度下要 HEATag 箭头后结合测序。以后利用的 11447 个人体体组织细胞中,85.66% 都能能够 HEATag 长条码明确输入到原植物动物群,范例间是交叉被污染的不多,UMAP 聚类解析法解析也可以证实,HEATag 长条码与植物动物群特女性朋友人类基因组特性的高度保持一致。 一会儿,检验水平进这一步提升等级:研发拜谱生物选择在 4℃下产品标签鲜美感受损上皮神经元、在环境温度下产品标签甲醇加固受损上皮神经元,还还可以直接产品标签受损上皮神经元核。可是一样全场最佳:各个水平下,样例产品标签与种群新信息均极具非常不错的涉及性,分割更准率超 95%。虽然甲醇加固会会导致略微的转录本相互造成的污染,受损上皮神经元核化学合成会产生小量 RNA 外流,受损上皮神经元种类的注解可是一样与鲜美感样例要保持统一,单位证明 HEATag 还可以产品标签不一样外理水平下的实验所样例。

Fig2: HEATag 可在不一样必备条件下实现单細胞转录组混样具体分析

会标签喂奶节肢动物界和海洋环境无脊椎骨节肢动物界的原代生殖细胞

若说上皮生殖细胞系各种测试是 “基础条件题”,那机构样表是 “扩展题”, 这个样表一般因上皮生殖细胞类型的僵化、条件适宜性专项 ,成标出科技的 “重薄弱点”,而 HEATag 恰巧在这个 “重薄弱点” 上展现什么了特点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸机构,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅仅能被确切辨别,那些最主要神经细胞形式的聚类分析法结论都清析可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋资源生态学的兼容性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种类转录组存在较高统一性,都没有发生因高盐区域影响的 “标志不起作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可保证辅乳两栖动物集体样版多方面 scRNA-seq 定性分析

Fig4: HEATag可达成新鲜的浮游生物无脊椎神经部分动物多大 scRNA-seq 探讨

HEATag与上皮细胞的融入就不会使得转录组的不错变化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在成功完成标签作业的同时,不易对后期的的转录成分析产生侵扰,确保了研究分析数据库的真时性。

Fig5: HEATag不太会作用样板的 RNA 表答模式英文

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未来的可期

HEATag 能为单肿瘤细胞设计引来是什么?

HEATag 的交换价值,远以上于 “防止标出大问题”,它的协调性性和普遍意义,时未为单组织细胞论述使用更好将性

从应用3d场景来看看

HEATag 能网络覆盖从 “简洁明了相比剖析”(如癌进行与普通进行、用量正确处理与对应)到 “大总量钻研分析”(如进行神经元图谱建模、高通骁龙量淘汰)的全範圍供需。由于 PIP-seq、Stereo-cell 等最新科技可扩容技术应用的發展,HEATag 还能进步骤提拔单神经元钻研分析的通量,助力器研究组织搞好最大总量的活动。

从跨范围竞争力来说

HEATag 不仅仅可用在于转录组学,还能与表观染色体组学、蛋白质组学、的空间组学等高能力配合,顺利通过个性定制检索和寡核苷酸回文序列,HEATag 不错轻易融进了 不一样的组学流程步骤,不影向数字信号驯服广度。而且,由于HEATag还不错壮大单神经元糖组学理论研究高能力。

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联合动态图片

拜谱生态学与陈凯教援实现目标分式的运算进行合作相关

值得买重视的是,在 HEATag 枝术显显现出较大软件实力的底色下,拜谱生态学已与我国南方深海环境科学實驗性与水利福建實驗性室(珠海)陈凯客座教授已达成初阶段协议有意向的。双方彼此工作上规划致力于 HEATag 枝术的产业群化离地、成果转化项目管理转为等方法进行的深度协同,持续推进相应低投入、跨植物物种的单肿瘤癌人体细胞记号枝术速度快软件于实际效果成果转化项目管理场景中,为更大實驗性室出具提高效率、经济实惠的单肿瘤癌人体细胞研究分析平台,转向成果转化项目管理工作上者在肿瘤癌人体细胞生态学学、深海环境生态学学、皮肤疾病机理等教育领域认定更大攻克
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