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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T安排体人体細胞系膜也可以快速精确癌病安排体人体細胞系膜面的重点结构相融性软型体(MHC)呈递的抗原而启用免役抗体影响。MHC I类(MHC-I)团伙与CD8+ T安排体人体細胞系膜完美间用,其呈递的肽重点来历于内源性胞质蛋清酶的蛋清酶酶体吸附,而MHC II类(MHC-II)团伙重点理解于专业技术抗原提呈安排体人体細胞系膜,与CD4+ T安排体人体細胞系膜完美间用,其呈递的肽存在进行内体方式吸附的胞外和胞内蛋清酶(图1)。因,快速精确由MHC团伙呈递的癌病抗原对於设计方案依赖感T安排体人体細胞系膜快速精确和处理癌病安排体人体細胞系膜的合理和应急的癌病免役抗体方法是重要性的的。由于质谱(MS)的免役抗体肽组学(Immunopeptidomics)也可以从各种安排体人体細胞系膜系、癌病结构和绿色健康结构中高通骁龙量、随时签别MHC整合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力含有MHC以及切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到抗体肽队列还有全文翻译后遮盖数据信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo重新测序技术工艺,不依赖现有数据库,挺高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰厚的数据源阐述方式为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的方式

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 实践具体步骤

NO.2 物品特征

NO.3 剖析內容(部份)

NO.4 送样意见和建议

范例概述

01 考核机制分析

句子考题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发表论文杂物:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一种种核伤害蛋白质,在癌症复发中三天两头过表示,逐项为癌症发生了的驱动软件客观因素。当下,靶向口服药XPO1的小大分子正被作为临床试验治疗癌症口服药。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 本身起源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 恶性肿瘤-天然免疫医治

好文章便秘尴尬检查经历:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

收录报刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶意胸膜间皮瘤(MPM)就就是种生存率劣质的肉瘤样癌性淋巴肿瘤。是由于现阶段的控制方法或缺方法效果,由此急切需要需要新的控制措施。上述情况其T血细胞侵及,作著比如MPM就就是个适用的控制性胃癌防疫针的的目标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用研究背景质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶性肿瘤胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学检则

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 病菌mRNA预苗激发

新闻稿件问题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

先生发表报刊:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过来源于质谱的抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌感然的Hela组织和HCT-116组织中检测MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

免役系统性抗体肽组学是蛋白酶质组学的某个飞速成长 的节点,它专业于研究分析免役系统性抗体体系中由常见聚集性混溶性塑料体(MHC)或人类白细泡膜抗原(HLA)团伙呈递的免役系统性抗体肽。一些免役系统性抗体肽是神经元膜表皮呈递的肽段,就才可以被T神经元膜设别,以此激发免役系统性抗体发应。研究背景质谱的免役系统性抗体肽组学就变为判定MHC蛋白酶呈递肽的金标准方式方法,就才可以会判定有差异 生理变化和病症的情况下有差异 聚集性和神经元膜类别中的免役系统性抗体肽组,列如 直营瘤或艾滋病毒影响的神经元膜。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫系统肽组检查测量服务管理,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能准确的且立即能提供免役肽队列,看到其他非先进典型免役肽,逐级淘汰出安全可靠新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

对比论文论文参考文献

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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